MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome chromosome I

Total Repeats: 11407

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017270	AT	4	8	12	19	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017270	TA	3	6	27	32	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017270	TTA	2	6	42	47	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017270	CTA	2	6	51	56	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017270	CAA	2	6	95	100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017270	ATCA	2	8	283	290	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017270	T	6	6	292	297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017270	A	8	8	325	332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017270	CAG	2	6	2217	2222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017270	CAA	2	6	2224	2229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017270	GCC	2	6	2245	2250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_017270	TCAA	2	8	2261	2268	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017270	TTAT	2	8	3899	3906	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017270	TGG	2	6	3926	3931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017270	TGG	2	6	3982	3987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017270	TAA	2	6	4087	4092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017270	CGTA	2	8	4467	4474	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017270	AAT	2	6	4480	4485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017270	AGT	2	6	4649	4654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017270	GACGCC	2	12	4702	4713	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017270	CAA	2	6	4717	4722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017270	ACTC	2	8	4784	4791	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017270	TCCT	2	8	6283	6290	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017270	AAT	2	6	6293	6298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017270	TG	3	6	7101	7106	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017270	AGT	2	6	7166	7171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017270	ATCAAA	2	12	7187	7198	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017270	ACT	2	6	7211	7216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017270	CTC	2	6	7373	7378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_017270	TGAG	2	8	7398	7405	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017270	AGA	2	6	8865	8870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017270	GA	3	6	11090	11095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017270	TGA	2	6	11192	11197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017270	CAC	2	6	11211	11216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_017270	GGT	2	6	11228	11233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017270	TGA	2	6	11246	11251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017270	GTCA	2	8	11309	11316	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017270	CCGA	2	8	11337	11344	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017270	TCA	2	6	11380	11385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017270	CGG	2	6	11402	11407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017270	GAC	2	6	11415	11420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017270	CGG	2	6	11438	11443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017270	GT	3	6	11458	11463	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017270	GGT	2	6	11465	11470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017270	CT	3	6	11478	11483	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017270	CGG	2	6	11510	11515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017270	CAT	2	6	11538	11543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017270	TAC	2	6	11594	11599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017270	GAA	2	6	11727	11732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017270	A	6	6	11736	11741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017270	ATG	2	6	11881	11886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017270	CAA	2	6	11915	11920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017270	TGG	2	6	11936	11941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017270	GTG	2	6	11962	11967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017270	AAC	2	6	11985	11990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017270	AAG	2	6	12001	12006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017270	GAA	2	6	12014	12019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017270	TGA	2	6	12041	12046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017270	CCAAA	2	10	12107	12116	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
60	NC_017270	TTC	2	6	12128	12133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017270	ATGA	2	8	12162	12169	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017270	AAGCG	2	10	12200	12209	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017270	ATT	2	6	12228	12233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017270	GCG	2	6	12237	12242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017270	GCG	2	6	12255	12260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017270	GC	3	6	12292	12297	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017270	GCGG	2	8	12387	12394	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017270	CCGTAA	2	12	12410	12421	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017270	TGT	2	6	12487	12492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017270	AAG	2	6	12499	12504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017270	TCA	2	6	12514	12519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017270	CAT	4	12	12562	12573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017270	CTG	2	6	12611	12616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017270	CTT	2	6	12622	12627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017270	CCA	2	6	12680	12685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_017270	A	6	6	12698	12703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017270	TGAT	2	8	12844	12851	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017270	GCC	2	6	12886	12891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_017270	TGC	2	6	12907	12912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017270	TG	3	6	12949	12954	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017270	AAG	2	6	13012	13017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017270	GCTGA	2	10	13056	13065	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_017270	TACT	2	8	13116	13123	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017270	TTGA	2	8	13191	13198	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017270	GTG	2	6	13219	13224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017270	CAG	2	6	13241	13246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017270	GCC	2	6	13251	13256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_017270	CGC	2	6	13284	13289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_017270	GTCT	2	8	13291	13298	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017270	CGT	2	6	13371	13376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017270	ATG	2	6	13377	13382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017270	ACG	2	6	13425	13430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017270	CGT	2	6	13455	13460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017270	AGC	2	6	13505	13510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017270	GCT	2	6	13519	13524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017270	T	7	7	13524	13530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017270	TCCCT	2	10	13545	13554	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
98	NC_017270	GTT	2	6	13624	13629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017270	TTA	2	6	13686	13691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017270	T	6	6	13700	13705	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017270	CATT	2	8	13726	13733	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017270	T	7	7	13732	13738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017270	T	7	7	14494	14500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017270	A	7	7	14502	14508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017270	GAG	2	6	14613	14618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017270	CCG	2	6	16558	16563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_017270	CG	3	6	19656	19661	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017270	TTC	2	6	19663	19668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017270	A	6	6	19682	19687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017270	AAT	2	6	19752	19757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017270	TC	3	6	19796	19801	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017270	GGT	2	6	19847	19852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017270	CA	3	6	19910	19915	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017270	GT	3	6	19944	19949	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017270	ACAA	2	8	19984	19991	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_017270	TTGT	2	8	20014	20021	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017270	ATA	2	6	20032	20037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017270	CG	3	6	20624	20629	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017270	A	6	6	20994	20999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017270	T	6	6	21016	21021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017270	ACC	2	6	21036	21041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_017270	GAT	2	6	21349	21354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017270	TGG	2	6	21357	21362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017270	ATT	2	6	21369	21374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017270	AAT	2	6	21376	21381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017270	CTT	2	6	21411	21416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017270	TGAC	2	8	21642	21649	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017270	T	7	7	21713	21719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017270	TTTC	2	8	21776	21783	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017270	AGT	2	6	22830	22835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017270	ATGG	2	8	22841	22848	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017270	AAGCGA	2	12	22856	22867	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_017270	CTAT	2	8	22881	22888	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017270	AAAGAG	2	12	23000	23011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017270	CCT	2	6	29319	29324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_017270	CAA	2	6	29330	29335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017270	TG	3	6	29354	29359	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017270	TTC	2	6	29389	29394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017270	G	6	6	29406	29411	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017270	TATC	2	8	29438	29445	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_017270	T	7	7	29477	29483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017270	GTCT	2	8	29485	29492	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017270	A	7	7	29500	29506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017270	T	7	7	29531	29537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017270	CGT	2	6	29574	29579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_017270	T	6	6	29650	29655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017270	AC	3	6	29702	29707	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_017270	T	6	6	29740	29745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017270	CAC	2	6	29764	29769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
150	NC_017270	TA	3	6	29772	29777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017270	TCAT	2	8	29862	29869	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_017270	CG	3	6	29982	29987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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162	NC_017270	CG	3	6	30410	30415	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
163	NC_017270	CAT	2	6	30426	30431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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183	NC_017270	T	6	6	35614	35619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_017270	TCAA	2	8	35637	35644	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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290	NC_017270	TGG	2	6	57754	57759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
291	NC_017270	TCC	2	6	57780	57785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
292	NC_017270	GGA	2	6	57797	57802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
293	NC_017270	GGT	2	6	57917	57922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
294	NC_017270	CGG	2	6	58004	58009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
295	NC_017270	TCA	2	6	58032	58037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
296	NC_017270	CGT	2	6	58112	58117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
297	NC_017270	GCT	2	6	58166	58171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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305	NC_017270	TCCGC	2	10	58761	58770	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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424	NC_017270	GATCT	2	10	100698	100707	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
425	NC_017270	TAA	2	6	101651	101656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
426	NC_017270	T	6	6	102184	102189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
427	NC_017270	TAT	3	9	102221	102229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
428	NC_017270	AAC	2	6	102231	102236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
429	NC_017270	A	6	6	102397	102402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
430	NC_017270	CTTTTT	2	12	102445	102456	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
431	NC_017270	TCATT	2	10	102622	102631	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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